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    从头设计环肽

从头设计高亲和力环肽

发布日期:2025-07-21

发布者🧝🏽‍♀️: 意昂4平台

从头设计高亲和力环肽服务介绍

1 产品概述

本产品借助计算设计与分子模拟手段🐹,依据诱饵蛋白构建结构稳定💚🥮、功能多样的环状肽分子♗。该技术打破传统依赖天然模板的设计方式,为新药研发等提供有力支撑👩🏼‍🎨。其优势明显:一是能从头设计,摆脱天然肽序列限制;二是闭环结构可提升稳定性与体内药代表现;三是具备高通量筛选能力,结合 AI 与自动化流程👱🏽‍♂️,快速输出候选序列供实验验证📎🟪。

2 产品设计流程

    2.1 结合位点的确定

利用蛋白与底物结合的活性区域设置结合位点区域用于环肽设计。

    2.2 环肽设计

确定好诱饵蛋白的对接位点后使用Evobind2设计对接位点区域的环肽🪽,将环肽的长度设置为6-20个氨基酸。

    2.3 Autodock vina初步虚拟筛选

意昂4将筛选到的环肽进入Autodock Vina虚拟筛选步骤,可以更有效的、快速的识别出稳定性好👸🏼、亲和力强的蛋白和环肽的互作✌🏻。这是一个重要的筛选指标,有助于提高最终筛选结果的准确性。

    2.4 Autodock vina极限精确对接

提取虚拟筛选Max Affinity值中的10%进入精细化筛选,精细化筛选是对接精度更高,对接结果更可靠的一步,Max Affinity值越低,对接预测越准确。

3 拟交付结果

1

诱饵蛋白建模PDB文件

2

设计1000条环肽的序列以及相应的PDB文件

3

全数据Excel表(包括诱饵建模评分)

4

Autodock vina对接原始数据

5

实验报告




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